Nanodrop 1000检测全基因组关联中，260/230值的重要意义

在超微量分光光度计NanoDrop 1000检测全基因组关联中，260/230的值为什么意义重要呢？

全基因组关联研究(GWAS)现已作为筛选疾病易感基因的工具被广泛应用，影响GWAS成功的最基本要素是标本的质量。

本研究收集强直性脊柱炎(AS)标本经过质检(NanoDrop 1000超微量分光光度计和PicoGreen测浓度)后，芯片结果中少部分标本CallRate值较低。回顾发现这些标本NanoDrop检测的260/230值偏低。本研究旨在探讨260/230值对GWASDNA质检的意义。

选取本实验室标本库中nanodrop及PicoGreen浓度>50ng/uL的1101例行聚合酶链反应(PCR)检测。将260/230值按PCR成功与否分2组，用受试者工作曲线(ROC)评价260/230值对PCR结果的鉴别效率，并确定最佳诊断点及特异度为90％及95％的点，采用SPSS13.0统计软件处理数据。

结果：260/230值对PCR结果有较好鉴别效率(AUC=0.708)；其中最佳诊断点、特异度为90％及95％的点依次为：0.895(特异度0.58，灵敏度0.81)，2.175(特异度0.90，灵敏度0.20)，2.305(特异度0.95，灵敏度0.16)。

Nanodrop检测的260/230值对预测芯片的成功与否有重要意义，对于260/230值较低的标本应加做PCR进行质检以确保芯片成功率。

根据实际情况，较高的特异度可以减少资源的浪费，因此我们建议选取特异度较高(0.95)但灵敏度相对较低(0.16)的点(260/230值为2.305)作为评价标本纯度的标准以提高标本质检的效率。